在水电站中，机端电压6000V以上的高压发电机，中性线不接地。机端电压400V低压发电机的中性线一般不被人重视，对低压发电机的中性线处理，电站一般采用直接接地的形式，其实也是可行的，但不是最佳的处理方法。如果发电机的中性线与主变压器的中性线都是直接接地，电流在发电机的中性线和主变压器的中性线之间形成环流，中性发热。电压不是很高，电流可能很大，会消耗一定的电功率。另外，有个别地区（例如广东阳山地区）的水电站采用加电阻的方法进行处理，降低中性线电流，他们的做法是：在发电机的中性点和变压器中性点之间装设一个电炉或串接多个电炉。本人认为应将发电机的中性线取消！可将发电机所发的电量全部经计量设备上网。如果直接取消中性又不可行，因为有很多二次设备需要用到发电机的中性线，如：励磁、保护、同期、自发用电等，还有个别发电机组在中性线断开后出现并网困难，三相同期指示灯不能同步，原因是中性点漂移。
较为合理的处理方法是：在发电机的中性线和主变压器的中性线之间串入一个刀开关或断路器，在并网之前合上，并网之后拉断。也可以使用出口断路器的辅助接点通过接触器实现上述功能。一般的小型水电站建议在发电机的中性线和主变压器的中性线之间并入一个10－20A的断路器，在开机并网前将这个断路器合上，并网后当中性线的电流加大到一定数值时这个断路器会自动断开，这样处理效果较为理想。